RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439512.5

TOM1-207, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 3

Gene TOM1, Length 800 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-207ENST00000439512 A8MUA0 341 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 A8MUI8 341 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 J3QKU1 62 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CYR61O00622 381 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 COPEO14579 308 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 UQCRHP07919 91 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ITGAMP11215 1152 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CRHR1P34998 444 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 MLLT10P55197 1068 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLC13A2Q13183 592 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLAMF1Q13291 335 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 RCN2Q14257 317 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 FRG2Q64ET8 278 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PLAG1Q6DJT9 500 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 TMEM237Q96Q45 408 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 FRG2BQ96QU4 278 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CSF3RQ99062 836 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 LYRM4Q9HD34 91 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.49■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 G3V2L1 256 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PLPP1O14494 284 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ETHE1O95571 254 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PROCP04070 461 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 MYL2P10916 166 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 HSD17B7P56937 341 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 AP2B1P63010 937 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLC18A2Q05940 514 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 IFT88Q13099 833 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 MFAP5Q13361 173 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CUL3Q13618 768 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 EXT1Q16394 746 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CCDC153Q494R4 210 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CRB2Q5IJ48 1285 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLC6A19Q695T7 634 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CCNYL1Q8N7R7 359 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CCDC63Q8NA47 563 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 M1APQ8TC57 530 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SERPINI1Q99574 410 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ELOVL6Q9H5J4 265 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 STMN3Q9NZ72 180 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 RAB21Q9UL25 225 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PLAAQ9Y263 795 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 TENM4Q6N022 2769 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SCN2AQ99250 2005 aa15.48■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 BAHCC1Q9P281 2608 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PLIN3O60664 434 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CTNSO60931 367 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 OR4F21O95013 312 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CPA3P15088 417 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CPN2P22792 545 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 IGFL2Q6UWQ7 119 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ZYG11AQ6WRX3 759 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 DNAJB14Q8TBM8 379 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PNPLA2Q96AD5 504 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CCDC126Q96EE4 140 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 KCNK13Q9HB14 408 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ZNF225Q9UK10 706 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SPACA6W5XKT8 324 aa15.47■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 TGFBR3LH3BV60 316 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 EEDO75530 441 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SCELO95171 688 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 MLYCDO95822 493 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 TUBBP07437 444 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 BSGP35613 385 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SOX11P35716 441 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 ARFIP1P53367 373 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLC26A5P58743 744 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 IGFBP7Q16270 282 aa15.46■□□□□ 0.07
TOM1-207ENST00000439512 FAM219BQ5XKK7 198 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms