RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 PROCP04070 461 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 SERPINA6P08185 405 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 NAA20P61599 178 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 IRF8Q02556 426 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 MFAP5Q13361 173 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 E2F2Q14209 437 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 BTBD16Q32M84 506 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZS92 163 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ZBTB9Q96C00 473 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 SCYL1Q96KG9 808 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 MAGEB18Q96M61 343 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 IP6K3Q96PC2 410 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM237Q96Q45 408 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 HBEGFQ99075 208 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 OR51B5Q9H339 312 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ASF1BQ9NVP2 202 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ANKRD10Q9NXR5 420 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 MID2Q9UJV3 735 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 PCTPQ9UKL6 214 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 NCKAP5O14513 1909 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 PLPP1O14494 284 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 CLEC3AO75596 197 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 WISP2O76076 250 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 TGFB1P01137 390 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 SERPINA7P05543 415 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 BPGMP07738 259 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 SOX8P57073 446 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 RAB38P57729 211 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 SLC26A5P58743 744 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF33BQ06732 778 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 GTF2H2Q13888 395 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 NR6A1Q15406 480 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 HHATQ5VTY9 493 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 QSOX2Q6ZRP7 698 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 MMP21Q8N119 569 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 BEST3Q8N1M1 668 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 KRT78Q8N1N4 520 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 OR7G3Q8NG95 312 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 UCN3Q969E3 161 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 CCDC126Q96EE4 140 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 OR1F2PQ96R84 312 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 EMCNQ9ULC0 261 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 TMCO1Q9UM00 188 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-216ENST00000428482 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 GMNCA6NCL1 334 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 LDB3O75112 727 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 WFS1O76024 890 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 WDPCPO95876 746 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 GBAP04062 536 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 ALPPP05187 535 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 CD63P08962 238 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 CPA3P15088 417 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-216ENST00000428482 LSP1P33241 339 aa9.58□□□□□ -0.88
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