RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 SBK2P0C263 348 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 PCP11498 1178 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ODC1P11926 461 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CPA3P15088 417 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CAPN2P17655 700 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 PEX3P56589 373 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 IYDQ6PHW0 289 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TMEM270Q6UE05 265 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 MCM10Q7L590 875 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CCDC91Q7Z6B0 441 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SPATA18Q8TC71 538 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 LIPHQ8WWY8 451 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.865e-6■□□□□ 8.5
RBM39-211ENST00000426951 GGHQ92820 318 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 LRRC2Q9BYS8 371 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 VIPAS39Q9H9C1 493 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 S100A14Q9HCY8 104 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CTSZQ9UBR2 303 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 LRRD1A4D1F6 860 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SHISA7A6NL88 538 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CHUKO15111 745 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SYT7O43581 403 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 FMO6PO60774 539 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 FGF19O95750 216 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ACADSP16219 412 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 VCLP18206 1134 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SHC1P29353 583 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 FCGR2CP31995 323 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CTNNB1P35222 781 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ETV5P41161 510 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TAF6P49848 677 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ATP4BP51164 291 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 NME5P56597 212 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 RBBP4Q09028 425 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 RPS6KA1Q15418 735 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SMU1Q2TAY7 513 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 RNF130Q86XS8 419 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 LAX1Q8IWV1 398 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 FAM222BQ8WU58 562 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 PTP4A1Q93096 173 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 FAM46BQ96A09 425 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 C11orf52Q96A22 123 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ULK4Q96C45 1275 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 EPSTI1Q96J88 318 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ERGIC2Q96RQ1 377 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 PINK1Q9BXM7 581 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TRIM7Q9C029 511 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 WDR41Q9HAD4 459 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 MED17Q9NVC6 651 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SPG21Q9NZD8 308 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 STX8Q9UNK0 236 aa3.45□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 PDHXO00330 501 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 IGHV3-13P01766 116 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 RPL9P32969 192 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CRYBA2P53672 197 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ADARP55265 1226 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 FCHO2Q0JRZ9 810 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SPHARQ15513 63 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ECSCRQ19T08 205 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 IFI44LQ53G44 452 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 KCTD11Q693B1 232 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 NEPROQ6NW34 567 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CARM1Q86X55 608 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CACUL1Q86Y37 369 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TRPV3Q8NET8 790 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 RASL10AQ92737 203 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TAAR6Q96RI8 345 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ATF6BQ99941 703 aa3.44□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 STRADBQ9C0K7 418 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms