RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANGPTL1O95841 491 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTSR1P30989 418 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADPRHP54922 357 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUP107P57740 925 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRB2Q5IJ48 1285 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADCK2Q7Z695 626 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGMAQ96B86 450 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGED4Q96JG8 741 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC28A3Q9HAS3 691 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FZD3Q9NPG1 666 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMCD1Q9NZU5 365 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM9Q9P0T7 183 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TESMINQ9Y4I5 508 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa17.83■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52A4PA6NMU1 304 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDPK1O15530 556 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XPNPEP2O43895 674 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMPRSS11DO60235 418 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNTTP04053 509 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKLRP30613 574 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1E2P47887 323 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DSTNP60981 165 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE3DQ7Z6J8 389 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NATD1Q8N6N6 113 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2L8Q8NGY9 312 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5P2Q8WZ92 322 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NODALQ96S42 347 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF347Q96SE7 839 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABRG3Q99928 467 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOL4Q9BPW4 351 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THSD1Q9NS62 852 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5AR2Q9P296 337 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSRAQ9UJ68 235 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MOSPD1Q9UJG1 213 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANGPT4Q9Y264 503 aa17.82■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF25A6NGN4 478 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM64BA6NI03 449 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTGES3LE9PB15 166 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MANFP55145 182 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEURL3Q96EH8 262 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAM29Q9UKF5 820 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPSM3Q9Y4H4 160 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX5Q9Y5X3 404 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFRSF11BO00300 401 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC3AO75596 197 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFNA14P01570 189 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FMO3P31513 532 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMBIM6P55061 237 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPRL3Q12980 569 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAXO2Q658L1 398 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CREB3L4Q8TEY5 395 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PITX2Q99697 317 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOOQ9BUR5 198 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEUROD4Q9HD90 331 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM184CQ9NVA4 438 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC1BQ9P126 229 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AASSQ9UDR5 926 aa17.81■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E9PQ18 207 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNJ13O60928 360 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOL3O60936 208 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAM23O75077 832 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRKP42685 505 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSTM5P46439 218 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EMP3P54852 163 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT33BQ14525 404 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UAP1L1Q3KQV9 507 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAIR1Q6GTX8 287 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDE2Q6IQ49 451 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEACAM20Q6UY09 585 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC30A8Q8IWU4 369 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL17RCQ8NAC3 791 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52E1Q8NGJ3 308 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GIPC3Q8TF64 312 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABARAPL3Q9BY60 117 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S1PR5Q9H228 398 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SZT2Q5T011 3432 aa17.8■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa17.79■□□□□ 0.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms