RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 MTTPP55157 894 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 HSD17B7P56937 341 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-202ENST00000414620 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-202ENST00000414620 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 TMEM156Q8N614 296 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-202ENST00000414620 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 RPTNQ6XPR3 784 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.48□□□□□ -0.09
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ACTB-202ENST00000414620 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.099e-7■■■□□ 18.5
ACTB-202ENST00000414620 LDB3O75112 727 aa14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-202ENST00000414620 TERF2Q15554 542 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-202ENST00000414620 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-202ENST00000414620 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 MEMO1Q9Y316 297 aa14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-202ENST00000414620 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CDK2AP1O14519 115 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PEX1O43933 1283 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 HS6ST1O60243 411 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 KERAO60938 352 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 OR2J2O76002 312 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ZFAND5O76080 213 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SSR4P51571 173 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 GPR143P51810 404 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CAV1Q03135 178 aa14.46□□□□□ -0.09
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