RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396308.3

VAMP1-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene VAMP1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-202ENST00000396308 FAM53BQ14153 422 aa14.61□□□□□ -0.07
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VAMP1-202ENST00000396308 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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VAMP1-202ENST00000396308 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.59□□□□□ -0.07
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