RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 MAN2A2P49641 1150 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CORO7P57737 925 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MLF1P58340 268 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ABATP80404 500 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RELAQ04206 551 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SYT16Q17RD7 645 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 HKDC1Q2TB90 917 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CCDC38Q502W7 563 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 AMER3Q8N944 861 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GPATCH11Q8N954 259 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CAMKVQ8NCB2 501 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 IQCDQ96DY2 449 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 Q96MF0 132 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CARD6Q9BX69 1037 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 IPPKQ9H8X2 491 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CBLCQ9ULV8 474 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ARID1AO14497 2285 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 A0A0G2JNJ9 132 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CLCA1A8K7I4 914 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 A8MVJ9 347 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CCL22O00626 93 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PSMD3O43242 534 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 AVILO75366 819 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CRLF1O75462 422 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FPR1P21462 350 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 BMP5P22003 454 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FPR2P25090 351 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TACR1P25103 407 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLC26A5P58743 744 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PRAMEP78395 509 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLC10A1Q14973 349 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ARHGAP19Q14CB8 494 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 AFTPHQ6ULP2 937 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CBLL1Q75N03 491 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PCGF5Q86SE9 256 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR1F2PQ96R84 312 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PIP5K1AQ99755 562 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 HPF1Q9NWY4 346 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 Q9UFV3 132 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 X6R8D5 127 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MPDZO75970 2070 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FAM166BA8MTA8 275 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FOXS1O43638 330 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 KIF5CO60282 957 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GPC4O75487 556 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 C1orf105O95561 183 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SERPINC1P01008 464 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 NAT1P18440 290 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GRK2P25098 689 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PSMB5P28074 263 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CCR7P32248 378 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ADRA1AP35348 466 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TTPAP49638 278 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SSR4P51571 173 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CLCN2P51788 898 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TPM4P67936 248 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms