RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376227.3

CCDC22-201, Transcript of coiled-coil domain containing 22, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC22, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22-201ENST00000376227 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TSPAN11A1L157 253 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TTC36A6NLP5 189 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 C5orf58C9J3I9 102 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ADAP00813 363 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TIMP2P16035 220 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 LAG3P18627 525 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 UQCRC2P22695 453 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 CNR2P34972 360 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 MC1RQ01726 317 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 RHAGQ02094 409 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ARSIQ5FYB1 569 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 REEP3Q6NUK4 255 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 DPPA4Q7L190 304 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TMEM25Q86YD3 366 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 AP2M1Q96CW1 435 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 OR5M11Q96RB7 305 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 OR51B5Q9H339 312 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 KLHL3Q9UH77 587 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 M0R129 80 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ARHGAP33O14559 1287 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 GASTP01350 101 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 NPPBP16860 134 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 GJA1P17302 382 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 POU1F1P28069 291 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 CASP3P42574 277 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SLC15A1P46059 708 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TMCO6Q96DC7 493 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TLR4O00206 839 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 KMOO15229 486 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 KRT8P05787 483 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 KLK1P06870 262 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ELFN1P0C7U0 828 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SPNP16150 400 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 S100A1P23297 94 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 PDHA2P29803 388 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 CRISP3P54108 245 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 CARTPTQ16568 116 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ERAP2Q6P179 960 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ATCAYQ86WG3 371 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 WDR48Q8TAF3 677 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SETD6Q8TBK2 473 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SAMD11Q96NU1 681 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 CORO1BQ9BR76 489 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SGPP1Q9BX95 441 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 KCND3Q9UK17 655 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TET1Q8NFU7 2136 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SCG5P05408 212 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 OSMP13725 252 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 MAGP20916 626 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 MPEG1Q2M385 716 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 NATD1Q8N6N6 113 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 UCK2Q9BZX2 261 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 ASAH2Q9NR71 780 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 AHSPQ9NZD4 102 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC22-201ENST00000376227 IL36AQ9UHA7 158 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms