RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 STIP1P31948 543 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 HPDP32754 393 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 FEN1P39748 380 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASMTP46597 345 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCL11P51671 97 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GEMP55040 296 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PAX9P55771 341 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 BACE1P56817 501 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GMFBP60983 142 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 BTG1P62324 171 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 HERV-K104P63124 156 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 IRX4P78413 519 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCZ1BP86790 482 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSPA14Q0VDF9 509 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR1C1Q15619 314 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 INAQ16352 499 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 C3AR1Q16581 482 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 NKAIN2Q5VXU1 208 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 C18orf65Q6ZTR6 163 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q6ZVQ6 151 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADCK1Q86TW2 530 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 C17orf64Q86WR6 236 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CATSPERDQ86XM0 798 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC22A15Q8IZD6 547 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ELMOD1Q8N336 334 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAB42Q8N4Z0 105 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR5T2Q8NGG2 359 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR56B1Q8NGI3 324 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR4D10Q8NGI6 311 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR4L1Q8NH43 312 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPR148Q8TDV2 347 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHURC1Q8WUH1 139 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM190Q8WZ59 177 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 C14orf79Q96F83 325 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 C16orf58Q96GQ5 468 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSGA13Q96PP4 275 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ERGIC2Q96RQ1 377 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 EPYCQ99645 322 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASCL2Q99929 193 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 AGPAT1Q99943 283 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ABCG4Q9H172 646 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 MARCH7Q9H992 704 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SDF2L1Q9HCN8 221 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SOHLH2Q9NX45 425 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLEK2Q9NYT0 353 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCF19Q9Y242 345 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 NUDCQ9Y266 331 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR1A2Q9Y585 309 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBE4BO95155 1302 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF123Q5XPI4 1314 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM205AQ6ZU69 1335 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DISP3Q9P2K9 1392 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM89A2RUT3 159 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANHXE9PGG2 379 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCSO14618 274 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHEK1O14757 476 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SIGLEC5O15389 551 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SSX5O60225 188 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CEACAM4O75871 244 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR6A2O95222 327 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANGPTL1O95841 491 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TPBGLP0DKB5 382 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 EZRP15311 586 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DESP17661 470 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPX3P22352 226 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAJB1P25685 340 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCND2P30279 289 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 HLA-FP30511 346 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRNB4P30926 498 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRNA3P32297 505 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC6A12P48065 614 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SSTP61278 116 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNB1P62873 340 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 KARSQ15046 597 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CEBPEQ15744 281 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 WSCD2Q2TBF2 565 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms