RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 ACTL8Q9H568 366 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 MSX1P28360 303 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 MAGEA11P43364 429 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PMS2P3Q13401 168 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TBRG1Q3YBR2 411 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TMEM225Q6GV28 225 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SLC39A4Q6P5W5 647 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SLC9B2Q86UD5 537 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 MSLNLQ96KJ4 702 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 DERL2Q9GZP9 239 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ASB6Q9NWX5 421 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PPK0 400 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 KCNJ11Q14654 390 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PTGR1Q14914 329 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CCL14Q16627 93 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF584Q8IVC4 421 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 DTX3Q8N9I9 347 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TMEM185BQ9H7F4 350 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 S100PP25815 95 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PREPP48147 710 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GINS1Q14691 196 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 REEP3Q6NUK4 255 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 DMAC2Q9NW81 257 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 AGAP5A6NIR3 686 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ELK4P28324 431 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SLC9A3P48764 834 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CRHR2Q13324 411 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TGFBIQ15582 683 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GKN2Q86XP6 184 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TDP1Q9NUW8 608 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 UGT2B10P36537 528 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SFT2D3Q587I9 215 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PDSS2Q86YH6 399 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 RGCCQ9H4X1 137 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 POLE4Q9NR33 117 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.49■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TVP23AA6NH52 213 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 FARS2O95363 451 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 HEXBP07686 556 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF30P17039 623 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CELP19835 753 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SGCAQ16586 387 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CENPSQ8N2Z9 138 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 NR4A3Q92570 626 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF516Q92618 1163 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 KCNH6Q9H252 994 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 MRC1P22897 1456 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CKMT1AP12532 417 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 EMX2Q04743 252 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PRRT3Q5FWE3 981 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 OR9A1PQ8NGU1 263 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CD244Q9BZW8 370 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 H2BFMP0C1H6 154 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 MAGEA3P43357 314 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ECH1Q13011 328 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF675Q8TD23 568 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GKN3PP0CG01 181 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SLC16A9Q7RTY1 509 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 THRSPQ92748 146 aa15.48■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 IFNA5P01569 189 aa15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CARD17Q5XLA6 110 aa15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 DCDC5Q6ZRR9 648 aa15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ELP5Q8TE02 316 aa15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GPR22Q99680 433 aa15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PHLPP1O60346 1717 aa15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 RBBP9O75884 186 aa15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CFHP08603 1231 aa15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.47■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 LIPKQ5VXJ0 399 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms