RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa17■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 OR2L5Q8NG80 312 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 OR5P2Q8WZ92 322 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 KLHL25Q9H0H3 589 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 EPS8L2Q9H6S3 715 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 C1GALT1Q9NS00 363 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ACTR10Q9NZ32 417 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 FBXL21Q9UKT6 434 aa17■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 KCT2Q8NC54 265 aa16.98■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CYGBQ8WWM9 190 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 KCNC2Q96PR1 638 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 NLNQ9BYT8 704 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.98■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 FBXW2Q9UKT8 454 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 KNL1Q8NG31 2342 aa16.98■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PR48 441 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 OR2A25A4D2G3 310 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 CERS1P27544 350 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 MAGEA2P43356 314 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PRIM2P49643 509 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ARSFP54793 590 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SLC36A3Q495N2 470 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.98■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 TPD52L3Q96J77 140 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 POT1Q9NUX5 634 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 VNN3Q9NY84 501 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ABCG2Q9UNQ0 655 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ATG4BQ9Y4P1 393 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 hCG_2039718K7EN88 272 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PGRMC2O15173 223 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PRAMEF10O60809 474 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CTSVO60911 334 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 FKBP9O95302 570 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 MAOBP27338 520 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 LSSP48449 732 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CDK9P50750 372 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 FADDQ13158 208 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SCARB2Q14108 478 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 DAG1Q14118 895 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CYBRD1Q53TN4 286 aa16.97■□□□□ 0.31
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