RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC5A12Q1EHB4 618 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
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HOXD8-201ENST00000313173 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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HOXD8-201ENST00000313173 MAL2Q969L2 176 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 FAIM2Q9BWQ8 316 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 FOXQ1Q9C009 403 aa25.49■■□□□ 1.67
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HOXD8-201ENST00000313173 CXorf36Q9H7Y0 433 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 NEUROD4Q9HD90 331 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R7Q9NYW3 318 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 EHD3Q9NZN3 535 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 OR2A25A4D2G3 310 aa25.48■■□□□ 1.67
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HOXD8-201ENST00000313173 FAM170BA6NMN3 283 aa25.48■■□□□ 1.67
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HOXD8-201ENST00000313173 SVOPLQ8N434 492 aa25.48■■□□□ 1.67
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HOXD8-201ENST00000313173 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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HOXD8-201ENST00000313173 THEGQ9P2T0 379 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 GSAPA4D1B5 854 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 GUCY1B2O75343 617 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 TNFAIP8O95379 198 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 ALDH3A2P51648 485 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 TGM3Q08188 693 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 SLAMF1Q13291 335 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 DAG1Q14118 895 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 SIX5Q8N196 739 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 SLC37A2Q8TED4 501 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 HSH2DQ96JZ2 352 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 CHRDQ9H2X0 955 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 ASB4Q9Y574 426 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 SNX8Q9Y5X2 465 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 G3V2T6 193 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFS2O75306 463 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 HPRP00739 348 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 MAGP20916 626 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 CASP9P55211 416 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 SPIDRQ14159 915 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 MYBPC3Q14896 1274 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 SLC36A3Q495N2 470 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 ASPGQ86U10 573 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 STK32CQ86UX6 486 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 NT5CQ8TCD5 201 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 NELL2Q99435 816 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF696Q9H7X3 374 aa25.45■■□□□ 1.67
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