RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.98□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 PARVBQ9HBI1 364 aa14.98□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.98□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.98□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.98□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A0G2JMM0 328 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A1W2PPB8 328 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A1W2PRS3 328 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 URADA6NGE7 173 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 KIR3DP1A8MWS1 328 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 OR2J2O76002 312 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 ZFAND5O76080 213 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 MAN2A2P49641 1150 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 VPS41P49754 854 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 ASCL1P50553 236 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 PHKG1Q16816 387 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 CHSY3Q70JA7 882 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 CA13Q8N1Q1 262 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 PBKQ96KB5 322 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 NDNQ99608 321 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 EXO5Q9H790 373 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 DVL2O14641 736 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 HAUS5O94927 633 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 OR6B1O95007 311 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 LY6G6DO95868 133 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 EPXP11678 715 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 PPP2R1BP30154 601 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 MAGEA5P43359 124 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 SCTRP47872 440 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 DCAF7P61962 342 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 SP140Q13342 867 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 CSHL1Q14406 222 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 CREG2Q8IUH2 290 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 SLCO2A1Q92959 643 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 OR4K3Q96R72 315 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 SH3GL2Q99962 352 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 KLHL31Q9H511 634 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 LDAHQ9H6V9 325 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 ARL15Q9NXU5 204 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.96□□□□□ -0.01
CLEC1B-201ENST00000298527 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 WWP2O00308 870 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGEF9O43307 516 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 HCN1O60741 890 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ATP6AP2O75787 350 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CNR1P21554 472 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CXCR5P32302 372 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 AHRP35869 848 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SOX3P41225 446 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC13A2Q13183 592 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC10A1Q14973 349 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 XKR6Q5GH73 641 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 DUPD1Q68J44 220 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CALML6Q8TD86 181 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 LINGO1Q96FE5 620 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF14Q9UBS8 474 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 COL6A5A8TX70 2615 aa14.95□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MPDZO75970 2070 aa14.94□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MAGEB16A2A368 324 aa14.94□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.94□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.94□□□□□ -0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 C4orf51C9J302 202 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms