RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 C8orf4Q9NR00 106 aa21.63■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PCGF2P35227 344 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT1P36639 197 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MYBPC1Q00872 1141 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9A5Q14940 896 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO42Q6P3S6 717 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 CBLL1Q75N03 491 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 VTCN1Q7Z7D3 282 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PARGQ86W56 976 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf65Q8NCR3 313 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 OR5P2Q8WZ92 322 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 C1GALT1Q9NS00 363 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 WNT16Q9UBV4 365 aa21.62■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 GNGT2O14610 69 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 HSPB3Q12988 150 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM40Q6P9F5 258 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 KCT2Q8NC54 265 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ADI1Q9BV57 179 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 RPS6KA6Q9UK32 745 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 OR2A25A4D2G3 310 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 GLOD5A6NK44 160 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 WNT1P04628 370 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 UQCRC2P22695 453 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MAOBP27338 520 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 CERS1P27544 350 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MERTKQ12866 999 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 STK32CQ86UX6 486 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD60Q9BZ19 345 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 EPS8L2Q9H6S3 715 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ATG4BQ9Y4P1 393 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ASB4Q9Y574 426 aa21.61■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 CTSVO60911 334 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFS2O75306 463 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA2P43356 314 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 GCNT6Q5T4J0 391 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FCRL6Q6DN72 434 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 HS3ST5Q8IZT8 346 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 NATD1Q8N6N6 113 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 HSH2DQ96JZ2 352 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC61Q9BV99 259 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 NLNQ9BYT8 704 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FBXW2Q9UKT8 454 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JNG1 304 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 G3V2T6 193 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 KIR2DS3K7RE56 304 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K13O43283 966 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 KRT75O95678 551 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 GNAO1P09471 354 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 DRD2P14416 443 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 JUNDP17535 347 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ARSFP54793 590 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FADDQ13158 208 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 KIR2DS5Q14953 304 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 GUCD1Q96NT3 240 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ABCG2Q9UNQ0 655 aa21.6■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PR48 441 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 METTL12A8MUP2 240 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TNFSF14O43557 240 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP9O95302 570 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SNAP29O95721 258 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SEMG1P04279 462 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PRIM2P49643 509 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 CDK9P50750 372 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TEAD4Q15561 434 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP9P1Q75LS8 142 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ASPGQ86U10 573 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ADHFE1Q8IWW8 467 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FAM46DQ8NEK8 389 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 NFKBIDQ8NI38 313 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SHDQ96IW2 340 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TPD52L3Q96J77 140 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FAIM2Q9BWQ8 316 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 IL1RAPQ9NPH3 570 aa21.59■■□□□ 1.05
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