RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	SYT7	O43581	403 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CRCP	O75575	148 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM49	P0CI25	452 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM49C	P0CI26	452 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ODC1	P11926	461 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GJB2	P29033	226 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TNFSF10	P50591	281 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CCR4	P51679	360 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NDST2	P52849	883 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	BACE1	P56817	501 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA1024L	P59773	190 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RPS6KA1	Q15418	735 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SGCB	Q16585	318 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	UPP1	Q16831	310 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ODF2	Q5BJF6	829 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NLRP14	Q86W24	1093 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	METTL4	Q8N3J2	472 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GGH	Q92820	318 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C18orf12	Q96KH6	178 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LGMN	Q99538	433 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	KLK11	Q9UBX7	282 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	STX8	Q9UNK0	236 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ITM2B	Q9Y287	266 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ETV7	Q9Y603	341 aa		2.56	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PPR1	153 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C5orf51	A6NDU8	294 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ANPEP	P15144	967 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CTNNB1	P35222	781 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CRYBA2	P53672	197 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NME5	P56597	212 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ERVK-16	P61578	105 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MEF2D	Q14814	521 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C3AR1	Q16581	482 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TEX35	Q5T0J7	233 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	DOK6	Q6PKX4	331 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	METTL7B	Q6UX53	244 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CARM1	Q86X55	608 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SNX32	Q86XE0	403 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CACUL1	Q86Y37	369 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SFRP1	Q8N474	314 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC15	Q8TF66	581 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GUCD1	Q96NT3	240 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	AGAP3	Q96P47	875 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SSX3	Q99909	188 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PINK1	Q9BXM7	581 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM7	Q9C029	511 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NAPB	Q9H115	298 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	S100A14	Q9HCY8	104 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MTRR	Q9UBK8	725 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		2.55	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1B0GU03	582 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		2.54	□□□□□ -2

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