RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PERM1Q5SV97 790 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ANXA8L1Q5VT79 327 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 NANOGP8Q6NSW7 305 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD46Q86W74 232 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP21Q8N119 569 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PPCDCQ96CD2 204 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC3Q9BQI4 270 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ROGDIQ9GZN7 287 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 NANOGQ9H9S0 305 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ATAD3AQ9NVI7 634 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA5BQ9P283 1151 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CD300AQ9UGN4 299 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB4Q9Y574 426 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 WDFY4Q6ZS81 3184 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A096LPI6 279 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CPED1A4D0V7 1026 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 NME4O00746 187 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF883P0CG24 379 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 USP53Q70EK8 1073 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD13Q7L211 337 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR60Q8WVS4 1066 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM125Q96AQ2 219 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 INPP5KQ9BT40 448 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 NLNQ9BYT8 704 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE7BQ9NP56 450 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CMTM6Q9NX76 183 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 VAPAQ9P0L0 249 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM9Q9P0T7 183 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL3Q9UH77 587 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 BTNL2Q9UIR0 455 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS13AQ96RL7 3174 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CIB2O75838 187 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ME2P23368 584 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN6P29350 595 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPC1P48995 793 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS53Q2L4Q9 553 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MPEG1Q2M385 716 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PROX2Q3B8N5 592 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 LAIR1Q6GTX8 287 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CYB5D1Q6P9G0 228 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ARPINQ7Z6K5 226 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 TICAM1Q8IUC6 712 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MSRB3Q8IXL7 192 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF148Q8N7C7 305 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS37AQ8NEZ2 397 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 NAT6Q93015 286 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MIEF2Q96C03 454 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF285Q96NJ3 590 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC115Q96NT0 180 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MIEF1Q9NQG6 463 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SOHLH2Q9NX45 425 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCL2Q9UPR0 1127 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 POMPQ9Y244 141 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PRORSD1PA6NEY8 169 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 TXNDC9O14530 226 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CASC3O15234 703 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MGRN1O60291 552 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CTSBP07858 339 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 DRD2P14416 443 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ALOX12P18054 663 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKN2CP42773 168 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC74AQ0VAA2 488 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 WASHC2DQ5SRD0 308 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD27Q96NW4 1050 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SERINC2Q96SA4 455 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM8Q9BZR9 551 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMYND15Q9H091 742 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A13Q9NSD5 602 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A7Q9Y694 548 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 RFXANKO14593 260 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K7O43318 606 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 GUCY1B2O75343 617 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CKMT1AP12532 417 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 MUM1Q2TAK8 710 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 PRTGQ2VWP7 1150 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB134Q4QY38 66 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 RABL3Q5HYI8 236 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 DBX2Q6ZNG2 339 aa23.6■■□□□ 1.37
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