RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 LCTLQ6UWM7 567 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ADCK2Q7Z695 626 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 Q8NA96 180 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ACMSDQ8TDX5 336 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 SMPDL3AQ92484 453 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 FKBP10Q96AY3 582 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 MIEF2Q96C03 454 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 MTBPQ96DY7 904 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 C5orf34Q96MH7 638 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 OR2A5Q96R48 311 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PLCD4Q9BRC7 762 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 C12orf49Q9H741 205 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF304Q9HCX3 659 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CTSFQ9UBX1 484 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 RNF112Q9ULX5 631 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.56□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 EXPH5Q8NEV8 1989 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CCDC189A1A4V9 331 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF839A8K0R7 811 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 H3BQF6 201 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 FFAR3O14843 346 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 GPR42O15529 346 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.527e-7■■■□□ 18.3
LINC00963-215ENST00000622972 GLRA3O75311 464 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 KLHL18O94889 574 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 WDR47O94967 919 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CCNDBP1O95273 360 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ETHE1O95571 254 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 TUBBP07437 444 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 KRT15P19012 456 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PIK3CGP48736 1102 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 HTR6P50406 440 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CDH13P55290 713 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 FOXA1P55317 472 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ARG2P78540 354 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 KLC1Q07866 573 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 DOC2AQ14183 400 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.523e-7■■■■□ 20.3
LINC00963-215ENST00000622972 NKG7Q16617 165 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF678Q5SXM1 525 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 MFSD4BQ5TF39 518 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 FAAH2Q6GMR7 532 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PRMT9Q6P2P2 845 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 COX15Q7KZN9 410 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 TMPRSS11BQ86T26 416 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 PDSS2Q86YH6 399 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 AMER3Q8N944 861 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 TCP10LQ8TDR4 215 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.55□□□□□ -1.52
LINC00963-215ENST00000622972 SLC5A11Q8WWX8 675 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms