RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDH17	O14917	1159 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CNTN5	O94779	1100 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SPARC	P09486	303 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	MPI	P34949	423 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TAS2R50	P59544	299 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	ST3GAL3	Q11203	375 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SEC23B	Q15437	767 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF878	C9JN71	531 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	HCRT	O43612	131 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	RCBTB2	O95199	551 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	HPR	P00739	348 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	MT-ND5	P03915	603 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	DNAJB1	P25685	340 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	ACVRL1	P37023	503 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	RAB8A	P61006	207 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	NDUFA9	Q16795	377 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	PPTC7	Q8NI37	304 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	COQ10A	Q96MF6	247 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CD180	Q99467	661 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	GNG8	Q9UK08	70 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	GRM6	O15303	877 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CAPN15	O75808	1086 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	NOXA1	Q86UR1	476 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	GPC2	Q8N158	579 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	C6orf47	O95873	294 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CHM	P24386	653 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	DCK	P27707	260 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	PYCR1	P32322	319 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CCL23	P55773	120 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	VAMP2	P63027	116 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	GALNT2	Q10471	571 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM124A	Q86V42	546 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	NUDT13	Q86X67	352 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	PADI3	Q9ULW8	664 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	RP1	P56715	2156 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FAM200B-223	ENST00000622362	RBBP9	O75884	186 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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