RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TSG101	Q99816	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	MIS12	Q9H081	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0G2JNG1	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GTH9	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	BECN2	A8MW95	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	DSCR3	O14972	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF749	O43361	778 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TCF21	O43680	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GSR	P00390	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	VIP	P01282	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ACP5	P13686	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	F3	P13726	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	UGP2	Q16851	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	LIX1	Q8N485	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	NUS1	Q96E22	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SARG	Q9BW04	601 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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