RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589934.1

APBA3-204, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-204	ENST00000589934	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	TEX37	Q96LM6	180 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	TAAR9	Q96RI9	348 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	HEY2	Q9UBP5	337 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	DAPP1	Q9UN19	280 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	SATB2	Q9UPW6	733 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934		A0A1B0GX78	115 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934		A0A1W2PR48	441 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CYR61	O00622	381 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PROM1	O43490	865 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PRPS2	P11908	318 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	IL12A	P29459	219 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	SSR2	P43308	183 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	RAP1GDS1	P52306	607 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	LIM2	P55344	173 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CLDN8	P56748	225 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	RAB15	P59190	212 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	TGM3	Q08188	693 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	SLAMF1	Q13291	335 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PTGR1	Q14914	329 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	GSTA3	Q16772	222 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	NDUFA9	Q16795	377 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	NXN	Q6DKJ4	435 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	LCN10	Q6JVE6	187 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	LIX1	Q8N485	282 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	UCN3	Q969E3	161 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	MARK4	Q96L34	752 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ZPBP	Q9BS86	351 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	NDC1	Q9BTX1	674 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	EBPL	Q9BY08	206 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	LYRM4	Q9HD34	91 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	MYNN	Q9NPC7	610 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PISD	Q9UG56	409 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		12.49	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	NDUFAB1	O14561	156 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CHST10	O43529	356 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	RDH16	O75452	317 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	DLGAP3	O95886	979 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	NTRK1	P04629	796 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	IDO1	P14902	403 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	OR1D4	P47884	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	UFM1	P61960	85 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	OLR1	P78380	273 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PDE7A	Q13946	482 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	DSG2	Q14126	1118 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	MMP21	Q8N119	569 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	RILP	Q96NA2	401 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CATSPER2	Q96P56	530 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	CENPK	Q9BS16	269 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		12.48	□□□□□ -0.41
APBA3-204	ENST00000589934	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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