RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 XKR6Q5GH73 641 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 NEPROQ6NW34 567 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 RTL4Q6ZR62 310 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CENPUQ71F23 418 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 P3H2Q8IVL5 708 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.19■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 TERF2Q15554 542 aa20.18■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC13A2Q13183 592 aa20.17■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa20.17■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.16■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 CLCA1A8K7I4 914 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 HIST1H2ADP20671 130 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TERF1P54274 439 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 CD200R1Q8TD46 325 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 SNF8Q96H20 258 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 SCYL1Q96KG9 808 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-205ENST00000588780 SPRR3Q9UBC9 169 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 HIVEP2P31629 2446 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CLDN4O14493 209 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 CD53P19397 219 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 SAT1P21673 171 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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