RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	METTL4	Q8N3J2	472 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	RNF217	Q8TC41	542 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SUSD6	Q92537	303 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	LGALS12	Q96DT0	336 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SEMA3D	O95025	777 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC16A8	O95907	504 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CYP4B1	P13584	511 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CD36	P16671	472 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	UQCRC2	P22695	453 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	KEL	P23276	732 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OPRL1	P41146	370 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	HMGA2	P52926	109 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MAPK10	P53779	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC14A1	Q13336	389 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	AQP6	Q13520	282 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	LACC1	Q8IV20	430 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516		Q96MT0	163 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PIP5K1A	Q99755	562 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FBXO10	Q9UK96	956 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ICK	Q9UPZ9	632 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCL16	O15467	120 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MTX2	O75431	263 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCNB2	O95067	398 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADH1C	P00326	375 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDK1	P06493	297 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	POU2F2	P09086	479 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FURIN	P09958	794 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RHCE	P18577	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CTSK	P43235	329 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	BDKRB1	P46663	353 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDK6	Q00534	326 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPIB	Q01892	262 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RELA	Q04206	551 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DPT	Q07507	201 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF77	Q15935	545 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	INA	Q16352	499 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	LCTL	Q6UWM7	567 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NAGS	Q8N159	534 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	STX19	Q8N4C7	294 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	LINC00471	Q8N535	108 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR4K3	Q96R72	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PELI2	Q9HAT8	420 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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