RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 PDPRQ8NCN5 879 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PSMF1Q92530 271 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 HAS2Q92819 552 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 WNT2BQ93097 391 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2E3Q969T4 207 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SCYL1Q96KG9 808 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 EHD1Q9H4M9 534 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 NT5DC2Q9H857 520 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SNX15Q9NRS6 342 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ABI3Q9P2A4 366 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PQ72 361 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 A8MUA0 341 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN4O14493 209 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SH3BGRLO75368 114 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 KRT38O76015 456 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL2O95198 593 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 WDPCPO95876 746 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TGFB1P01137 390 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 EPB42P16452 691 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MAOAP21397 527 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINB9P50453 376 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R50P59544 299 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SLC13A2Q13183 592 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RUNX2Q13950 521 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RCN2Q14257 317 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MEP1AQ16819 746 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 LGSNQ5TDP6 509 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MED27Q6P2C8 311 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RELL1Q8IUW5 271 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CA13Q8N1Q1 262 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SLC5A8Q8N695 610 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 OR2L5Q8NG80 312 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RHEBL1Q8TAI7 183 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 M1APQ8TC57 530 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 GRHL3Q8TE85 626 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM10Q96HG1 83 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 F2RL3Q96RI0 385 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PAFAH2Q99487 392 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SH3GL2Q99962 352 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ACTR8Q9H981 624 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 LANCL2Q9NS86 450 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SCN3AQ9NY46 2000 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 NFU1Q9UMS0 254 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ASB1Q9Y576 335 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MAST4O15021 2626 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC189A1A4V9 331 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 HMX2A2RU54 273 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 OR5H15A6NDH6 313 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 C4orf51C9J302 202 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEF4O60810 478 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RASAL1O95294 804 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 CBX6O95503 412 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 IFNA16P05015 189 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 RBP1P09455 135 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF8P28908 595 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SOX11P35716 441 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 TNFSF10P50591 281 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 MTTPP55157 894 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 SLC26A5P58743 744 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-214ENST00000583153 PHEXP78562 749 aa7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms