RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 UTS2RQ9UKP6 389 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MKLN1Q9UL63 735 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A7Q9Y694 548 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TAF1LQ8IZX4 1826 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GUH1 482 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPQ1 181 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 PPP3CBP16298 524 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 C9orf50Q5SZB4 431 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 PDSS1Q5T2R2 415 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GPR157Q5UAW9 335 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HACD4Q5VWC8 232 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NIPAL1Q6NVV3 410 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS57Q6UWY2 283 aa2.92□□□□□ -1.94
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