RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTOV1Q86YD1 416 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 PACRGLQ8N7B6 248 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIML2Q8N7C3 387 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2L5Q8NG80 312 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC37A2Q8TED4 501 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM162AQ96A26 154 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 COQ10BQ9H8M1 238 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRDM7Q9NQW5 492 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB26Q9ULW5 256 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1W2PRB8 838 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 WNT1P04628 370 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 DRD2P14416 443 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 UGT2B7P16662 529 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD38P28907 300 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 FRKP42685 505 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 RACK1P63244 317 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHRNB3Q05901 458 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 VEZF1Q14119 521 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 RGNQ15493 299 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADRM1Q16186 407 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPP4R4Q6NUP7 873 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 EID3Q8N140 333 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 NETO1Q8TDF5 533 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 PATE1Q8WXA2 126 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNC2Q96PR1 638 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM4Q9C037 500 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLHL31Q9H511 634 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAGIXQ9H6Y5 334 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 YY1AP1Q9H869 796 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 C8orf4Q9NR00 106 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACTR10Q9NZ32 417 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZW10O43264 779 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 DENRO43583 198 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SERPIND1P05546 499 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 JUNDP17535 347 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF793Q6ZN11 406 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF145Q96MT1 663 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEPHS2Q99611 448 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 C17orf62Q9BQA9 187 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC61Q9BV99 259 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYNPO2LQ9H987 977 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 EHD3Q9NZN3 535 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR6C74A6NCV1 312 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSF2P04141 144 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SSR2P43308 183 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 MVDP53602 400 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLA2G16P53816 162 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC5A12Q1EHB4 618 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 MMP21Q8N119 569 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 NT5CQ8TCD5 201 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 THAP11Q96EK4 314 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF597Q96LX8 424 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLHL20Q9Y2M5 609 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 KMT2EQ8IZD2 1858 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRSS23O95084 383 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 NME1P15531 152 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOLH1Q04609 750 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXO42Q6P3S6 717 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 FKBP9P1Q75LS8 142 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 VN1R4Q7Z5H5 301 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR5BQ86VZ2 330 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 AMER3Q8N944 861 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 TM4SF19Q96DZ7 209 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 C2orf74A8MZ97 194 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPM1DO15297 605 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP3K13O43283 966 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ERI3O43414 337 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 TPST1O60507 370 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 LDLRP01130 860 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF528Q3MIS6 628 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR52N2Q8NGI0 321 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5P2Q8WZ92 322 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 NCLNQ969V3 563 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPACA7Q96KW9 195 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 CIB1Q99828 191 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 C4orf51C9J302 202 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM58BPP0C7Q3 252 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SP9P0CG40 484 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 MED21Q13503 144 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC9A5Q14940 896 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM40Q6P9F5 258 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ENPP6Q6UWR7 440 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC36A4Q6YBV0 504 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM26Q6ZUK4 368 aa27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms