RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4C11Q6IEV9 310 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOMEZQ8IX15 550 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEX11GQ96HA9 241 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 HBEGFQ99075 208 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJB6O75190 326 aa31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKAR1AP10644 381 aa31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRK2P25098 689 aa31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CERS1P27544 350 aa31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF793Q6ZN11 406 aa31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS58Q8IYP2 241 aa31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 NMRK1Q9NWW6 199 aa31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC12A4Q9UP95 1085 aa31.28■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTR6P50406 440 aa31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABRAXAS2Q15018 415 aa31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAPTM4BQ86VI4 370 aa31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHISA5Q8N114 240 aa31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CA13Q8N1Q1 262 aa31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACOT4Q8N9L9 421 aa31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 NACC2Q96BF6 587 aa31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRB3Q9BUF7 120 aa31.27■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 AZIN1O14977 448 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNH1P13489 461 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARRB2P32121 409 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RUNX2Q13950 521 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf48Q6RUI8 117 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM151BQ8IW70 566 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D20Q96BZ9 403 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRELD1Q96HD1 420 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRORYQ9H606 182 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEMA3GQ9NS98 782 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHSPQ9NZD4 102 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 C3orf18Q9UK00 162 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAPP1Q9UN19 280 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC400499M0QZD8 3231 aa31.26■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERTM1A2A2V5 107 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM114B3SHH9 223 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 JRKO75564 520 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF4P08620 206 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 FURINP09958 794 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 BGNP21810 368 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC6AQ6EIG7 209 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB43Q86YS6 212 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS29Q9UBQ0 182 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MKL2Q9ULH7 1088 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP210LQ5VU65 1888 aa31.25■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC14CA4D256 554 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 IDSB3KWA1 339 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHEP01854 428 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 FHP07954 510 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 JAK1P23458 1154 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMP11P24347 488 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINB3P29508 390 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL28A1Q2UY09 1125 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CES4AQ5XG92 561 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 THAP4Q8WY91 577 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CATSPER2Q96P56 530 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACPTQ9BZG2 426 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYC1P08574 325 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 OTX2P32243 289 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 BSGP35613 385 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIM2P55344 173 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MINDY4Q4G0A6 757 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH2D4BQ5SQS7 431 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 KANK2Q63ZY3 851 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG14Q6ZNE5 492 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED25Q71SY5 747 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT13Q86X67 352 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLYBLQ8N0X4 340 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBCK1Q9BYM8 510 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYRM4Q9HD34 91 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPA4LO95757 839 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHEK2O96017 543 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 HEXBP07686 556 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMP2P54851 167 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB38P57729 211 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MFSD4BQ5TF39 518 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL4Q8N3J2 472 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 IP6K3Q96PC2 410 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 VN1R1Q9GZP7 353 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLHQ9Y253 713 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 FIS1Q9Y3D6 152 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAF6Q9Y4K3 522 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCN2AQ99250 2005 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MGAQ8IWI9 3026 aa31.22■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBB8Q3ZCM7 444 aa31.22■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCIMPQ6UWF3 145 aa31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms