RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ASF1BQ9NVP2 202 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PLA2G3Q9NZ20 509 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MAP10Q9P2G4 905 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 XPR1Q9UBH6 696 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TEKT2Q9UIF3 430 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 A8MUI8 341 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 STX16O14662 325 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 UGDHO60701 494 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TGFB1P01137 390 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CERS1P27544 350 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SLC26A5P58743 744 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PHF21BQ96EK2 531 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CMTM7Q96FZ5 175 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 KCNK13Q9HB14 408 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 STMN3Q9NZ72 180 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 FETUBQ9UGM5 382 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 DAPP1Q9UN19 280 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TENM4Q6N022 2769 aa20.03■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CYR61O00622 381 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CLDN4O14493 209 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 WDPCPO95876 746 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MYBL2P10244 700 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 GNLYP22749 145 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PIK3CBP42338 1070 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 UQCRFS1P47985 274 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TNFSF10P50591 281 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 LIM2P55344 173 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 HSD17B7P56937 341 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CYP4X1Q8N118 509 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 HUS1BQ8NHY5 278 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 KCMF1Q9P0J7 381 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.02■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 CLEC18AA5D8T8 446 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 H0YIV9 168 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 SMIM24O75264 130 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 SCELO95171 688 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 SBK3P0C264 359 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF33BQ06732 778 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 RCN2Q14257 317 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 ACER2Q5QJU3 275 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 TEX35Q5T0J7 233 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 CLEC18BQ6UXF7 455 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 FAM47BQ8NA70 645 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM52Q8NDY8 209 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 OR1N1Q8NGS0 311 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 ELP5Q8TE02 316 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 OR51B5Q9H339 312 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 LYRM4Q9HD34 91 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.01■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 OR5H15A6NDH6 313 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 SAGE2PA6NJ88 616 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 OR7A17O14581 309 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 SH3BGRLO75368 114 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 AP5B1Q2VPB7 878 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 FCRLBQ6BAA4 426 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 CNPY4Q8N129 248 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 RNF175Q8N4F7 328 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 REPS1Q96D71 796 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 DMRT3Q9NQL9 472 aa20■□□□□ 0.79
RNPS1-218ENST00000566180 PCTPQ9UKL6 214 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms