RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564343.5

TCF4-223, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 4

Gene TCF4, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-223	ENST00000564343	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	NF1	P21359	2839 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343		A0A1B0GX78	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CCL21	O00585	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CST8	O60676	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ONECUT2	O95948	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	F10	P00742	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SERPINC1	P01008	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	GYPC	P04921	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	RALB	P11234	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TNNT1	P13805	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MAG	P20916	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MCM3	P25205	808 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MST1	P26927	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ACADL	P28330	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ADRA1A	P35348	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	GRIA3	P42263	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	OR1D4	P47884	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	RAP2B	P61225	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZBED6	P86452	979 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MFAP5	Q13361	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	BRD3	Q15059	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TAZ	Q16635	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	KAZN	Q674X7	775 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PSMF1	Q92530	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	NR4A3	Q92570	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	NEU1	Q99519	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	COPS8	Q99627	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SARG	Q9BW04	601 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	WDR54	Q9H977	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	EURL	Q9NYK6	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ASF1A	Q9Y294	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	DSCR3	O14972	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	UNC5C	O95185	931 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	CELA2A	P08217	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	COX6B1	P14854	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	ITGAL	P20701	1170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-223	ENST00000564343	RBL1	P28749	1068 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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