RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CREG2Q8IUH2 290 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HID1Q8IV36 788 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC15A4Q8N697 577 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 C20orf202A1L168 122 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LEFTY2O00292 366 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 GUK1Q16774 197 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF559Q9BR84 538 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PDE7BQ9NP56 450 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 CDH15P55291 814 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 LCN9Q8WX39 176 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 CALML5Q9NZT1 146 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPL8 197 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH17O14917 1159 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PCCBP05166 539 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PEPDP12955 493 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 C5AR1P21730 350 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CALCRP30988 508 aa6.09□□□□□ -1.44
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