RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 TACC2O95359 2948 aa11.31□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 LRIT2A6NDA9 550 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM166BA8MTA8 275 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ACOT7O00154 380 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 FANCGO15287 622 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ZFAND5O76080 213 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TNNI3P19429 210 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 HSD17B7P56937 341 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 PPIAP62937 165 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 RUNX2Q13950 521 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 MORF4L2Q15014 288 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TERF2Q15554 542 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TSNQ15631 228 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 PAOXQ6QHF9 649 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 IL20RBQ6UXL0 311 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 KRT78Q8N1N4 520 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TTLQ8NG68 377 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 C16orf52Q8NHV5 167 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ASB15Q8WXK1 588 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 RND1Q92730 232 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 VPS39Q96JC1 886 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 UCK2Q9BZX2 261 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 AICDAQ9GZX7 198 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 MCCC2Q9HCC0 563 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 PSAT1Q9Y617 370 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 G3V3Y1 287 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 WWP2O00308 870 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 CLGNO14967 610 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 CERS1P27544 350 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC12A2P55011 1212 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ARL4CP56559 192 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB38P57729 211 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TAS2R39P59534 338 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 CDKL1Q00532 357 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 DR1Q01658 176 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 MGAT5Q09328 741 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 PMPCAQ10713 525 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 STX4Q12846 297 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 FBXO48Q5FWF7 155 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 XKR6Q5GH73 641 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 SPATA6LQ8N4H0 392 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 RPRMLQ8N4K4 120 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 PSD4Q8NDX1 1056 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 OR5M3Q8NGP4 307 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ASB5Q8WWX0 329 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ADAP2Q9NPF8 381 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 WWOXQ9NZC7 414 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 RNF6Q9Y252 685 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 SCN3AQ9NY46 2000 aa11.29□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 PINLYPA6NC86 204 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 CES2O00748 559 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 ZSCAN12O43309 604 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 OR6B1O95007 311 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 IVDP26440 423 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 CHRNB4P30926 498 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 LIM2P55344 173 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDSP2-205ENST00000549039 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms