RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDK4Q16654 411 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADNP2Q6IQ32 1131 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 LANCL3Q6ZV70 420 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDUFAF7Q7L592 441 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFT20Q8IY31 132 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRPV3Q8NET8 790 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCT6BQ92526 530 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD244Q9BZW8 370 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC6A16Q9GZN6 736 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 VPS11Q9H270 941 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF358Q9NW07 568 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPRC5BQ9NZH0 403 aa18.1■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A0G2JN53 185 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM221AA4D161 298 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 C19orf84I3L1E1 186 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC19A2O60779 497 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM153BP0C7A2 387 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 C8orf89P0DMQ9 161 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 MTHFD2P13995 350 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD22P20273 847 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADORA2A-AS1P86434 159 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 DOC2AQ14183 400 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCOLCEQ15113 449 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM83EQ2M2I3 478 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM153CQ494X1 144 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 XKR6Q5GH73 641 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM205Q6UW68 189 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABHD13Q7L211 337 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 MMP21Q8N119 569 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR78Q96P69 363 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAPS2Q9BXY5 557 aa18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 FBN3Q75N90 2809 aa18.08■□□□□ 0.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHST10O43529 356 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLHL2O95198 593 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SERPINA6P08185 405 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 MSH2P43246 934 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHIT1Q13231 466 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 VN1R5Q7Z5H4 357 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT78Q8N1N4 520 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 METTL21AQ8WXB1 218 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMIM10Q96HG1 83 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ENKD1Q9H0I2 346 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 LANCL2Q9NS86 450 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 IKBKGQ9Y6K9 419 aa18.08■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC14BA6NHZ5 514 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRR35P0CG20 571 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ART1P52961 327 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 IRF8Q02556 426 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACAP2Q15057 778 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC91Q7Z6B0 441 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 RHEBL1Q8TAI7 183 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBTD2Q8WUN7 234 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMUB1Q9BVT8 246 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF700Q9H0M5 742 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 RHBGQ9H310 441 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 EHD1Q9H4M9 534 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 NT5DC2Q9H857 520 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 OPTCQ9UBM4 332 aa18.07■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 CACNA1CQ13936 2221 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A1W2PQ72 361 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 URADA6NGE7 173 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKDD1BA6NHY2 528 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYCE1LA8MT33 242 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM49D1C9J1S8 452 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 B4GALT2O60909 372 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 FHP07954 510 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 MST1P26927 711 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAGEA12P43365 314 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SERPINB9P50453 376 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 BTN3A2P78410 334 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 RHAGQ02094 409 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 PFKFB4Q16877 469 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIRT6Q8N6T7 355 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSLPQ969D9 159 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 TBC1D20Q96BZ9 403 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR34Q96EX3 536 aa18.06■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 RIC8BQ9NVN3 520 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms