RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SCML1	Q9UN30	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ARID1A	O14497	2285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636		F8VP50	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PEX12	O00623	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	YY2	O15391	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC31A1	O15431	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZW10	O43264	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CTAG2	O75638	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GNA14	O95837	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LIPF	P07098	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RAP2A	P10114	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	UROS	P10746	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GOT1	P17174	413 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	COMT	P21964	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PTPN4	P29074	926 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC8A1	P32418	973 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MC5R	P33032	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PRCP	P42785	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP3CC	P48454	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KHK	P50053	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CLRN1	P58418	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MYL6	P60660	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OLR1	P78380	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HHEX	Q03014	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DMPK	Q09013	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ALCAM	Q13740	583 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NPY5R	Q15761	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KDM8	Q8N371	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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