RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520687.1

SPARC-202, Transcript of secreted protein acidic and cysteine rich, humanhuman

TSL 2

Gene SPARC, Length 1,598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARC-202ENST00000520687 MSANTD3Q96H12 275 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 EPYCQ99645 322 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 DOHHQ9BU89 302 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 MENTQ9BUN1 341 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 APOOQ9BUR5 198 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SARGQ9BW04 601 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 LGR4Q9BXB1 951 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 NLNQ9BYT8 704 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TOR3AQ9H497 397 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 EHD3Q9NZN3 535 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TAC3Q9UHF0 121 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.51□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 A0A1B0GVG6 124 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 A8MVJ9 347 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TNFRSF10CO14798 259 aa9.5□□□□□ -0.89
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SPARC-202ENST00000520687 YY2O15391 372 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 APBB3O95704 486 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PKLRP30613 574 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TIE1P35590 1138 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 AHRP35869 848 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PRIM2P49643 509 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ITGA1P56199 1179 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SELENOWP63302 87 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 HTR4Q13639 388 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SPIDRQ14159 915 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 FBXO43Q4G163 708 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ZNF773Q6PK81 442 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SPESP1Q6UW49 350 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 WDR48Q8TAF3 677 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SPARC-202ENST00000520687 C12orf66Q96MD2 445 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 REEP1Q9H902 201 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.5□□□□□ -0.89
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SPARC-202ENST00000520687 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ANGPT4Q9Y264 503 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SPTBN2O15020 2390 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 A0A1W2PPV9 198 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ADAMDEC1O15204 470 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 LINC01565O15544 149 aa9.5□□□□□ -0.89
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SPARC-202ENST00000520687 BSGP35613 385 aa9.5□□□□□ -0.89
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SPARC-202ENST00000520687 WASP42768 502 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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SPARC-202ENST00000520687 CXCR4P61073 352 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 HBA1P69905 142 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TGM3Q08188 693 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SLC14A1Q13336 389 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 KEAP1Q14145 624 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 FGL2Q14314 439 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 BROXQ5VW32 411 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TRIM69Q86WT6 500 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 NAGSQ8N159 534 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 C10orf111Q8N326 155 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 DNASE1L2Q92874 299 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.5□□□□□ -0.89
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