RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 PTTG1O95997 202 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 IFNA14P01570 189 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ADRA2AP08913 450 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS2R50P59544 299 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PDE7AQ13946 482 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ATAD3BQ5T9A4 648 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 NLGN4XQ8N0W4 816 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 METTL4Q8N3J2 472 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 MGLLQ99685 303 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ROGDIQ9GZN7 287 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB23Q9ULC3 237 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 HAT1O14929 419 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ZW10O43264 779 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNB2O95067 398 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 GASTP01350 101 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 LRG1P02750 347 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 SPNP16150 400 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM53Q6P2H8 277 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 AQP11Q8NBQ7 271 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 C16orf78Q8WTQ4 265 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 RHCGQ9UBD6 479 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 GULP1Q9UBP9 304 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 POU2F3Q9UKI9 436 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 H3BM21 787 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 KLHL18O94889 574 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf105O95561 183 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 POM121L1PQ3SYA9 428 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 AKAP14Q86UN6 197 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 MAFFQ9ULX9 164 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA0513O60268 411 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CBLP22681 906 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS53Q2L4Q9 553 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM215Q68D42 235 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 DESI1Q6ICB0 168 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 PTCHD4Q6ZW05 846 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF367Q7RTV3 350 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 DMRT3Q9NQL9 472 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 ENPP4Q9Y6X5 453 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA1671Q9BY89 1806 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 EFCAB10A6NFE3 127 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 GSTT2P0CG29 244 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 GSTT2BP0CG30 244 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CHMP24386 653 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 PNLIPRP1P54315 467 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 DUSP7Q16829 419 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM71E1Q6IPT2 247 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 KLHL17Q6TDP4 642 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SORCS1Q8WY21 1168 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS35Q96QK1 796 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 TRBC2A0A5B9 178 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 PIPSLA2A3N6 862 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SH3D21A4FU49 640 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 KLK1P06870 262 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 RHCEP18577 417 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MAPK9P45984 424 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 FRMPD2BQ6IN97 320 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 C19orf48Q6RUI8 117 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 LAS2Q8IYD9 372 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 AP2M1Q96CW1 435 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CORO1BQ9BR76 489 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 EFCAB11Q9BUY7 163 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 ENOPH1Q9UHY7 261 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MKLN1Q9UL63 735 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PRB8 838 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SOX6P35712 828 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 DGKEP52429 567 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 TP53BP2Q13625 1128 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 STARD3Q14849 445 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 BCL2A1Q16548 175 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 TSTQ16762 297 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SPANXN2Q5MJ10 180 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 ATCAYQ86WG3 371 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MTG2Q9H4K7 406 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 ITM2CQ9NQX7 267 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 ZAR1LA6NP61 321 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CTSLP07711 333 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 POU1F1P28069 291 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CNR2P34972 360 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SOAT1P35610 550 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 RPL3P39023 403 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CRISP1P54107 249 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms