RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 RIPK3Q9Y572 518 aa2.89□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa2.89□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1B0GVG6 124 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 FAM90A18PA6NE21 464 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 FAM90A16PA6NEW6 464 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ARGFXA6NJG6 315 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SHISA7A6NL88 538 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 HIDE1A8MVS5 230 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 GOLGA8KD6RF30 607 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ACKR2O00590 384 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 GPR171O14626 319 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 MAP2K7O14733 419 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ADAM20O43506 726 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 VEGFDO43915 354 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SUPT3HO75486 399 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 BMP10O95393 424 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 TNFRSF6BO95407 300 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 GAS8O95995 478 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 CSF2P04141 144 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 LCKP06239 509 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 LIPFP07098 398 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 CLTAP09496 248 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 FAM90A15PP0C7V4 464 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 FAM90A14PP0C7W9 464 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 MYBL1P10243 752 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 GHRP10912 638 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ACADMP11310 421 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 KRT5P13647 590 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 CEACAM1P13688 526 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 CHRNB2P17787 502 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 CYP3A5P20815 502 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 RPA1P27694 616 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 PTPN4P29074 926 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 HLA-FP30511 346 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ADORA1P30542 326 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SHMT1P34896 483 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 MDH1P40925 334 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 CASP3P42574 277 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 PTPN9P43378 593 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 CDKN1BP46527 198 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SLC11A1P49279 550 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SLC7A2P52569 658 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 OAZ1P54368 228 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SRP54P61011 504 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 UBE2HP62256 183 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF33BQ06732 778 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 EPS8Q12929 822 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 CHAF1BQ13112 559 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 PDK1Q15118 436 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 KYAT1Q16773 422 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ADCK5Q3MIX3 580 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 GTDC1Q4AE62 458 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 TCP11X2Q5H9J9 407 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 GLRA4Q5JXX5 417 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 C10orf120Q5SQS8 335 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 MPP7Q5T2T1 576 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 TTC22Q5TAA0 569 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 DUPD1Q68J44 220 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 CLEC6AQ6EIG7 209 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM71Q6P5X7 295 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 PRSS57Q6UWY2 283 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 Q6ZSV7 163 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM179Q6ZVK1 233 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SLC24A5Q71RS6 500 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF367Q7RTV3 350 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SZRD1Q7Z422 152 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ADGRA1Q86SQ6 560 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 LONP2Q86WA8 852 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 NR2C2APQ86WQ0 139 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 METTL23Q86XA0 190 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 PM20D2Q8IYS1 436 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SLC38A6Q8IZM9 456 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 NATD1Q8N6N6 113 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 BANPQ8N9N5 519 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 LRRC57Q8N9N7 239 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 FSIP1Q8NA03 581 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 ATG16L2Q8NAA4 619 aa2.88□□□□□ -1.95
ATXN3-211ENST00000511362 SETD9Q8NE22 299 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms