RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	CARM1	Q86X55	608 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	THYN1	Q9P016	225 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	AGRN	O00468	2067 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A087WWV3	80 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619		E9PAM4	449 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	FGF19	O95750	216 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANPEP	P15144	967 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	BCL3	P20749	454 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC1A4	P43007	532 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	C3AR1	Q16581	482 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC30A4	O14863	429 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SELE	P16581	610 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	LBP	P18428	481 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ELK3	P41970	407 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SCN1B	Q07699	218 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBBP4	Q09028	425 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CORO2A	Q92828	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619		A8MU76	341 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CLN5	O75503	358 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RLN1	P04808	185 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRELP	P51888	382 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	EVC	P57679	992 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NCKAP1-208	ENST00000495619	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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