RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.73□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 GPR173Q9NS66 373 aa4.73□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 THYN1Q9P016 225 aa4.73□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 OOEPA6NGQ2 149 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 MLNRO43193 412 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 TXNL1O43396 289 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 SH3BGRLO75368 114 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 TSPY1Q01534 308 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 ACY1Q03154 408 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 FOLH1Q04609 750 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 CEACAM7Q14002 265 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 SLC43A2Q8N370 569 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 OR6F1Q8NGZ6 308 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 TAAR6Q96RI8 345 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 IDI2Q9BXS1 227 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 WDR41Q9HAD4 459 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 PRR34Q9NV39 138 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.72□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SDR42E2A6NKP2 422 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SRRM5B3KS81 715 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 M0R296 226 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 ACSL4O60488 711 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SRD5A2P31213 254 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 EVCP57679 992 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 RBP5P82980 135 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 BFSP1Q12934 665 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 GLRX5Q86SX6 157 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 TBC1D10CQ8IV04 446 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SEPT8Q92599 483 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 CORO2AQ92828 525 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 NMUR1Q9HB89 426 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 CDH7Q9ULB5 785 aa4.71□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 ANKDD1BA6NHY2 528 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 ZNF749O43361 778 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 GP9P14770 177 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 CD1DP15813 335 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 RBBP4Q09028 425 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 PTK6Q13882 451 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 C3AR1Q16581 482 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 MCM10Q7L590 875 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 ADCK1Q86TW2 530 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 RPAINQ86UA6 219 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 NLRP14Q86W24 1093 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 KCNMB4Q86W47 210 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SUMF1Q8NBK3 374 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SLC35C1Q96A29 364 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 MARCH7Q9H992 704 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 DEPPQ9NTK1 212 aa4.7□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 A8MU76 341 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 K7EQG2 157 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 PSMA7O14818 248 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 P2RX6O15547 441 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 MT-ND1P03886 318 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SLC1A4P43007 532 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 GPR50Q13585 617 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 ECSCRQ19T08 205 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 MUC21Q5SSG8 566 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 HPS6Q86YV9 775 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 LRRC49Q8IUZ0 686 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 BANPQ8N9N5 519 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 ZPLD1Q8TCW7 415 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 SMPDL3AQ92484 453 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 NABP1Q96AH0 204 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 CCDC114Q96M63 670 aa4.69□□□□□ -1.66
USP34-216ENST00000487547 CCDC28BQ9BUN5 200 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms