RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485604.1

PHF20-212, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-212ENST00000485604 DERL2Q9GZP9 239 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ACBD3Q9H3P7 528 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 EHD1Q9H4M9 534 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 KLHL31Q9H511 634 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ZFATQ9P243 1243 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 PYCARDQ9ULZ3 195 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ASB1Q9Y576 335 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ZANQ9Y493 2812 aa4.06□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 A0A1B0GUH1 482 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 LRIT2A6NDA9 550 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 FAM159BA6NKW6 160 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 GABRR3A8MPY1 467 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ADAM10O14672 748 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 NDC80O14777 642 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 TAPBPO15533 448 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 PRMT3O60678 531 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 SLC19A2O60779 497 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 SLC25A12O75746 678 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 PIAS1O75925 651 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 WFS1O76024 890 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ALX3O95076 343 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 UNC5CO95185 931 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 RASAL1O95294 804 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 GUCA1CO95843 209 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 RNH1P13489 461 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CD1DP15813 335 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 TFEBP19484 476 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 HIST1H2ADP20671 130 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 MAOAP21397 527 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 PPP2R1BP30154 601 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CD96P40200 585 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 GDF5P43026 501 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 GPR143P51810 404 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 MLF1P58340 268 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 GPX6P59796 221 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 RAB8AP61006 207 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 RGS1Q08116 209 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ART3Q13508 389 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CSHL1Q14406 222 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CDSNQ15517 529 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 TGFBIQ15582 683 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 OR4D1Q15615 310 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 NSDHLQ15738 373 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 MEP1AQ16819 746 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 GFRALQ6UXV0 394 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 RPTNQ6XPR3 784 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CYS1Q717R9 158 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ABHD13Q7L211 337 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 BIVMQ86UB2 503 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 KLHL7Q8IXQ5 586 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 PALM2Q8IXS6 379 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 SLC5A8Q8N695 610 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 PDPRQ8NCN5 879 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 TRPV3Q8NET8 790 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 MS4A6EQ96DS6 147 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 GPR137Q96N19 417 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CSF3RQ99062 836 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 LPAR4Q99677 370 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 RBBP8Q99708 897 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 AIF1LQ9BQI0 150 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 TRIM8Q9BZR9 551 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 RHBGQ9H310 441 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 NT5DC2Q9H857 520 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 CAB39LQ9H9S4 337 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.05□□□□□ -1.76
PHF20-212ENST00000485604 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms