RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 B3GALT2O43825 422 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 ETHE1O95571 254 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 OTCP00480 354 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 MYZAPP0CAP1 466 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 IL10P22301 178 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 MTTPP55157 894 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 Q0VFX4 171 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 GGTA1PQ4G0N0 100 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 DEPDC1Q5TB30 811 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 GALNT16Q8N428 558 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 BANPQ8N9N5 519 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC63Q8NA47 563 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNC2Q96PR1 638 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 SERINC2Q96SA4 455 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 MKS1Q9NXB0 559 aa24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A088AWK7 358 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1W2PQ72 361 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SPAG7O75391 227 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 OR4F21O95013 312 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 HPP00738 406 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 CREB1P16220 341 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TGM3Q08188 693 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PCOLCEQ15113 449 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM35AQ53FP2 167 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TCTN3Q6NUS6 607 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 CHSY3Q70JA7 882 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 METTL21AQ8WXB1 218 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 GSTO2Q9H4Y5 243 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TMBIM4Q9HC24 238 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 MLXIPLQ9NP71 852 aa24.95■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 BTG2P78543 158 aa24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PHEXP78562 749 aa24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ABRAXAS2Q15018 415 aa24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 FRG2Q64ET8 278 aa24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD37Q7Z713 158 aa24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 VPS50Q96JG6 964 aa24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 FRG2BQ96QU4 278 aa24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR83Q9NYM4 423 aa24.94■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PLPP1O14494 284 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 CYC1P08574 325 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 JAK1P23458 1154 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ITGA3P26006 1051 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SSR2P43308 183 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 RAB38P57729 211 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 NDUFAF7Q7L592 441 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 CCNYL1Q8N7R7 359 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ACOT4Q8N9L9 421 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM47BQ8NA70 645 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM52Q8NDY8 209 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PLPP5Q8NEB5 264 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ARMC2Q8NEN0 867 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 RDH11Q8TC12 318 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC126Q96EE4 140 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF382Q96SR6 550 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 CSF3RQ99062 836 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF700Q9H0M5 742 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 DAPP1Q9UN19 280 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PLLPQ9Y342 182 aa24.93■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDH17O14917 1159 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 CELA2AP08217 269 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 CPA3P15088 417 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PGDP52209 483 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 RAP1GDS1P52306 607 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 LIM2P55344 173 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 MYBPC3Q14896 1274 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 NSDHLQ15738 373 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SGO1Q5FBB7 561 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 ASB18Q6ZVZ8 466 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SMC6Q96SB8 1091 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SENP1Q9P0U3 644 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC17A7Q9P2U7 560 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 TRPS1Q9UHF7 1281 aa24.92■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 SCELO95171 688 aa24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 MAOAP21397 527 aa24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4-202ENST00000483873 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms