RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 MYO1GB0I1T2 1018 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PLPP1O14494 284 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 IL3P08700 152 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CRATP43155 626 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PLA2G16P53816 162 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 NFATC3Q12968 1075 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 COX20Q5RI15 118 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 SAXO2Q658L1 398 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF605Q86T29 641 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 NEURL3Q96EH8 262 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 SIGLEC11Q96RL6 698 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 LTB4R2Q9NPC1 389 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 MYO9BQ13459 2157 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 IGLON5A6NGN9 336 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PCCBP05166 539 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ETFAP13804 333 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ANXA8P13928 327 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 LIMS1P48059 325 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 IL5RAQ01344 420 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 NPRL3Q12980 569 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ARMC8Q8IUR7 673 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 TAMM41Q96BW9 452 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 SCN3BQ9NY72 215 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 KIF17Q9P2E2 1029 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 APODP05090 189 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 INHBBP09529 407 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 TNFRSF4P43489 277 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CDK6Q00534 326 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 MC1RQ01726 317 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF740Q8NDX6 193 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 TTLQ8NG68 377 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 MAL2Q969L2 176 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PDXPQ96GD0 296 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 TPD52L3Q96J77 140 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 IL17FQ96PD4 163 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 FBRSQ9HAH7 460 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 TAS2R7Q9NYW3 318 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 HEPACAMQ14CZ8 416 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 GALNT10Q86SR1 603 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 SVOPQ8N4V2 548 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ANKRD53Q8N9V6 530 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 GIPC3Q8TF64 312 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 FAR1Q8WVX9 515 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 LGR4Q9BXB1 951 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PALMDQ9NP74 551 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CLEC1BQ9P126 229 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CLEC3AO75596 197 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SLC35G4P0C7Q5 338 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 RRM2P31350 389 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 XCR1P46094 333 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SARGQ9BW04 601 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 NLNQ9BYT8 704 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 WDR26Q9H7D7 661 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SPASTQ9UBP0 616 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 TAC3Q9UHF0 121 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 ENOPH1Q9UHY7 261 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 TNFRSF11BO00300 401 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 MID1O15344 667 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-212ENST00000477970 SH3BGRLO75368 114 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms