RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466539.1

PSME4-204, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene PSME4, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-204ENST00000466539 AQP5P55064 265 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 C21orf58P58505 322 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 TBPL1P62380 186 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 ADAM8P78325 824 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 BTKQ06187 659 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 NFYCQ13952 458 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 UGT8Q16880 541 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 ZNF425Q6IV72 752 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 FRA10AC1Q70Z53 315 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 CPLX4Q7Z7G2 160 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 SYT12Q8IV01 421 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 SLC25A45Q8N413 288 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 TEX9Q8N6V9 391 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 OR2T11Q8NH01 316 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 NEIL2Q969S2 332 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 FOPNLQ96NB1 174 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 OR52B2Q96RD2 323 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 KCNA7Q96RP8 456 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 NRTNQ99748 197 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 MYOCQ99972 504 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 HGH1Q9BTY7 390 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 CCDC106Q9BWC9 280 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 GSDMCQ9BYG8 508 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 PCBD2Q9H0N5 130 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 RHBGQ9H310 441 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 SAR1AQ9NR31 198 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 TAAR2Q9P1P5 351 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 OPTCQ9UBM4 332 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 ASF1AQ9Y294 204 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 RNF11Q9Y3C5 154 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 U3KQA8 63 aa5.9□□□□□ -1.46
PSME4-204ENST00000466539 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 A0A1B0GTQ1 180 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 TRPC5OSA6NMA1 111 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SCAMP1O15126 338 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 YY2O15391 372 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SNX2O60749 519 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 OR4F21O95013 312 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CLDN9O95484 217 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 LY86O95711 162 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CAPN1P07384 714 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ZNF883P0CG24 379 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 GAAP10253 952 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 HSD3B1P14060 373 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 GNAZP19086 355 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 HNF4AP41235 474 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ACTR1BP42025 376 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ACADVLP49748 655 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 HTR6P50406 440 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ARFIP2P53365 341 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ACTR1AP61163 376 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ABATP80404 500 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 BNIP1Q12981 228 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 NAE1Q13564 534 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 DOC2AQ14183 400 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 KRT72Q14CN4 511 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ELOCQ15369 112 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 KIF19Q2TAC6 998 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 CFAP157Q5JU67 520 aa5.89□□□□□ -1.47
PSME4-204ENST00000466539 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms