RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 CERS1P27544 350 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SSR2P43308 183 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SLCO1A2P46721 670 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RAP1GDS1P52306 607 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 VSNL1P62760 191 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MFAP5Q13361 173 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 AP5B1Q2VPB7 878 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PLAG1Q6DJT9 500 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TDRPQ86YL5 185 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 L3MBTL4Q8NA19 623 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 HUS1BQ8NHY5 278 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP4R1Q8TF05 950 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 LMF1Q96S06 567 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DMRT3Q9NQL9 472 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM216Q9P0N5 145 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PTGFRNQ9P2B2 879 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DCDC2Q9UHG0 476 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TEKT2Q9UIF3 430 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SPACA6W5XKT8 324 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM227AF5H4B4 570 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CDH16O75309 829 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 GLRA3O75311 464 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3BGRLO75368 114 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 OTCP00480 354 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS17P08708 135 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGAMP11215 1152 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 HSD17B3P37058 310 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TSFMP43897 325 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 HSD17B7P56937 341 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RUNX2Q13950 521 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RASA2Q15283 850 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR93Q6P2C0 686 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 EMBQ6PCB8 327 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 IGFL2Q6UWQ7 119 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00696Q6ZRV3 163 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF595Q8IYB9 648 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CYP4X1Q8N118 509 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SIRT6Q8N6T7 355 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 OR52B6Q8NGF0 335 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MZB1Q8WU39 189 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RGMAQ96B86 450 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 NTMT1Q9BV86 223 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 OR51B5Q9H339 312 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 LYRM4Q9HD34 91 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PRDM7Q9NQW5 492 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DAPP1Q9UN19 280 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SVILO95425 2214 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 DYTNA2CJ06 578 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 OR7A17O14581 309 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 WISP1O95388 367 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CELA2AP08217 269 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SBK3P0C264 359 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MAOAP21397 527 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CD97P48960 835 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ARFIP1P53367 373 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MLLT10P55197 1068 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 LIM2P55344 173 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS13P62277 151 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 HERVK_113P63132 956 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 BTG2P78543 158 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAF3Q13114 568 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC13A2Q13183 592 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 GGTA1PQ4G0N0 100 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ABHD17BQ5VST6 288 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 Q6ZS92 163 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 MILR1Q7Z6M3 343 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 IQCKQ8N0W5 287 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM151AQ8N4L1 468 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ACOT4Q8N9L9 421 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM47BQ8NA70 645 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 M1APQ8TC57 530 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-205ENST00000466097 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms