RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 RBP1P09455 135 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PCNAP12004 261 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 COL6A2P12110 1019 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 EPB42P16452 691 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CXCR2P25025 360 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CERS1P27544 350 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX11P35716 441 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD17B3P37058 310 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CDH13P55290 713 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LIM2P55344 173 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAF3Q13114 568 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SFT2D3Q587I9 215 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MED27Q6P2C8 311 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZS92 163 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD13Q7L211 337 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT78Q8N1N4 520 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2L5Q8NG80 312 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DOK4Q8TEW6 326 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MIB2Q96AX9 1013 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB9Q96C00 473 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 IPPKQ9H8X2 491 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC13O75165 2243 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PS29 197 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM23A6NLE4 172 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ESPNB1AK53 854 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 G3V2L1 256 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 STX16O14662 325 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TMPRSS11DO60235 418 aa6.57□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 WISP1O95388 367 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GBAP04062 536 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CREB1P16220 341 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CNTFP26441 200 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 UQCRFS1P47985 274 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB38P57729 211 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4D2P58180 307 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC26A5P58743 744 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ID2Q02363 134 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LAPTM5Q13571 262 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 NSDHLQ15738 373 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LIPJQ5W064 366 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 C18orf63Q68DL7 685 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.57□□□□□ -1.36
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