RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454859.7

ECHDC1-210, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-210ENST00000454859 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 NEURL3Q96EH8 262 aa6.51□□□□□ -1.37
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ECHDC1-210ENST00000454859 SLC6A18Q96N87 628 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 LRRC61Q9BV99 259 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.51□□□□□ -1.37
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ECHDC1-210ENST00000454859 ASNA1O43681 348 aa6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-210ENST00000454859 ATP6V1B2P21281 511 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 MPIP34949 423 aa6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-210ENST00000454859 TAF11Q15544 211 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 TRIP10Q15642 601 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 CYP51A1Q16850 503 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 IRGCQ6NXR0 463 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 ADCK2Q7Z695 626 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.5□□□□□ -1.37
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