RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RNF6Q9Y252 685 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 HSPB11Q9Y547 144 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 INSL6Q9Y581 213 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PLSCR1O15162 318 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 XPNPEP2O43895 674 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 AOC2O75106 756 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ACP5P13686 325 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GTF2F2P13984 249 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 UQCRC2P22695 453 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CD40LGP29965 261 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MAGEA8P43361 318 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ATP4BP51164 291 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PRKXP51817 358 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MADCAM1Q13477 382 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 UGCGQ16739 394 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR56A3Q8NH54 315 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MAPK15Q8TD08 544 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLCO2A1Q92959 643 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TMBIM1Q969X1 311 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 BMFQ96LC9 184 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MRI1Q9BV20 369 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SCML2Q9UQR0 700 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 VILLO15195 856 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CA12O43570 354 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 AK1P00568 194 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 H2BFMP0C1H6 154 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TUBG1P23258 451 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 HGSNATQ68CP4 663 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MBLAC2Q68D91 279 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF611Q8N823 705 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF366Q8N895 744 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PEX13Q92968 403 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RAB7BQ96AH8 199 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MALSU1Q96EH3 234 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TXN2Q99757 166 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TMEM100Q9NV29 134 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MEGF6O75095 1541 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ECI2O75521 394 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 HEXBP07686 556 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SFTPBP07988 381 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CSKP41240 450 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC26A5P58743 744 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DNAJB13P59910 316 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ACTBP60709 375 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ACTG1P63261 375 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GAS6Q14393 721 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MLIPQ5VWP3 458 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TMEM203Q969S6 136 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TOR3AQ9H497 397 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DHDHQ9UQ10 334 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TTC3P53804 2025 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SOBPA7XYQ1 873 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 A8MUI8 341 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 B4DGG1 531 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 UQCRC1P31930 480 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PHC2Q8IXK0 858 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ASB15Q8WXK1 588 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms