RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC5A8	Q8N695	610 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ESAM	Q96AP7	390 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SCMH1	Q96GD3	660 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	QRFPR	Q96P65	431 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ASPDH	A6ND91	283 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GABRR3	A8MPY1	467 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CLGN	O14967	610 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CD22	P20273	847 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	STX2	P32856	288 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GMPR	P36959	345 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R50	P59544	299 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	BTN3A2	P78410	334 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PMP22	Q01453	160 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	DLG1	Q12959	904 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RUNX2	Q13950	521 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1C1	Q15619	314 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	XKRX	Q6PP77	449 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ISCA2	Q86U28	154 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PPM1N	Q8N819	430 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	FBF1	Q8TES7	1133 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RHBG	Q9H310	441 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ASB1	Q9Y576	335 aa		16.59	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ITPR3	Q14573	2671 aa		16.58	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	NEURL1	O76050	574 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB38	P57729	211 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	NAB1	Q13506	487 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	DOC2A	Q14183	400 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PDK4	Q16654	411 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SPINK14	Q6IE38	97 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC25	Q86WR0	208 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2L5	Q8NG80	312 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	FAR2	Q96K12	515 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HES7	Q9BYE0	225 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CD274	Q9NZQ7	290 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF112	Q9ULX5	631 aa		16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0G2JN53	185 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	WISP2	O76076	250 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CASP2	P42575	452 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	RBPJ	Q06330	500 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDH1	Q08174	1060 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	16.57	■□□□□ 0.24	4e-6	■■□□□ 11.5
MRPL28-203	ENST00000429738	TERF2	Q15554	542 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TBCC	Q15814	346 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	XKR6	Q5GH73	641 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP4X1	Q8N118	509 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CCT6B	Q92526	530 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CD244	Q9BZW8	370 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ALG9	Q9H6U8	611 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		16.57	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CACNA1C	Q13936	2221 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A088AWK7	358 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CYR61	O00622	381 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GALT2	O43825	422 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CD46	P15529	392 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TFEB	P19484	476 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CRABP2	P29373	138 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PLA2G16	P53816	162 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HSD17B7	P56937	341 aa		16.56	■□□□□ 0.24

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