RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 PCSK5Q92824 1860 aa8□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SHANK1Q9Y566 2161 aa8□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PRAMEF4O60810 478 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 B4GALT2O60909 372 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 CTNSO60931 367 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SCELO95171 688 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 GSTA1P08263 222 aa7.99□□□□□ -1.13
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MT-TS1-201ENST00000387416 TAC1P20366 129 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFRSF8P28908 595 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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MT-TS1-201ENST00000387416 SLC29A2Q14542 456 aa7.99□□□□□ -1.13
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MT-TS1-201ENST00000387416 INAQ16352 499 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 MEP1AQ16819 746 aa7.99□□□□□ -1.13
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MT-TS1-201ENST00000387416 SLC5A8Q8N695 610 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8NA96 180 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 NTMT1Q9BV86 223 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 IPPKQ9H8X2 491 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNK13Q9HB14 408 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 DAPP1Q9UN19 280 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.99□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 MASP2O00187 686 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 OTCP00480 354 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 ITGAMP11215 1152 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PCNAP12004 261 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 CD22P20273 847 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP2R1BP30154 601 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFSF10P50591 281 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 RAP1GDS1P52306 607 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC26A5P58743 744 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 OLR1P78380 273 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 CUL3Q13618 768 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 RUNX2Q13950 521 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SERTAD2Q14140 314 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 ACER2Q5QJU3 275 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 CUZD1Q86UP6 607 aa7.98□□□□□ -1.13
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MT-TS1-201ENST00000387416 SLC22A9Q8IVM8 553 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP4X1Q8N118 509 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC126Q96EE4 140 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 CNDP1Q96KN2 507 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 F2RL3Q96RI0 385 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPINI1Q99574 410 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 AICDAQ9GZX7 198 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.98□□□□□ -1.13
MT-TS1-201ENST00000387416 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
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