RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF33BQ06732 778 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 DCAF10Q5QP82 559 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL6Q8TCB7 284 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 QRFPRQ96P65 431 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TRMOQ9BU70 441 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 AICDAQ9GZX7 198 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51B5Q9H339 312 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 LYRM4Q9HD34 91 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0G2JN53 185 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP6CO00743 305 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SOCS6O14544 535 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ULK1O75385 1050 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 JRKO75564 520 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CRCPO75575 148 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4F21O95013 312 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SEMA3DO95025 777 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 B3GALT4O96024 378 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HPP00738 406 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM87AP0C7U9 286 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HMOX2P30519 316 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CCL11P51671 97 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NEK2P51955 445 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB38P57729 211 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 AP2B1P63010 937 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNAB2Q13303 367 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CASP8Q14790 479 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CA13Q8N1Q1 262 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CNDP1Q96KN2 507 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 BRF2Q9HAW0 419 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 BLACEA4D250 179 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 C4orf51C9J302 202 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TM9SF1O15321 606 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TYROBPO43914 113 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PRMT3O60678 531 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 B4GALT2O60909 372 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3BGRLO75368 114 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SCELO95171 688 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ICAM2P13598 275 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HSD3B1P14060 373 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HSD3B2P26439 372 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CERS1P27544 350 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RUNX2Q13950 521 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PCLAFQ15004 111 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NSDHLQ15738 373 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SGO1Q5FBB7 561 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM205Q6UW68 189 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF843Q8N446 348 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 LANCL2Q9NS86 450 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 DAPP1Q9UN19 280 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PQ72 361 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MANBAO00462 879 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJB6O75190 326 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZWINTO95229 277 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINB5P36952 375 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms