RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PCGF2P35227 344 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CHN2P52757 468 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 STARD6P59095 220 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 VEZF1Q14119 521 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 COX20Q5RI15 118 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OR10G6Q8NH81 332 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OR5P2Q8WZ92 322 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TMBIM1Q969X1 311 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OR2A14Q96R47 310 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 POT1Q9NUX5 634 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CPNE7Q9UBL6 633 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OR6C74A6NCV1 312 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DLGAP1O14490 977 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ETFAP13804 333 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CTSEP14091 401 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KDELR2P33947 212 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CRATP43155 626 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CASP9P55211 416 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GK3PQ14409 553 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FAM180BQ6P0A1 224 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ABHD17CQ6PCB6 329 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GALNT10Q86SR1 603 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PARGQ86W56 976 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SFTPA2Q8IWL1 248 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DEFB119Q8N690 84 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 NATD1Q8N6N6 113 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OR5AK3PQ8NH89 298 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZFPM2Q8WW38 1151 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GPATCH2Q9NW75 528 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 C5AR2Q9P296 337 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 WNT16Q9UBV4 365 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 RPS6KA6Q9UK32 745 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0G2JNG1 304 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 GSAPA4D1B5 854 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 NDUFS2O75306 463 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TNFRSF21O75509 655 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CST1P01037 141 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 UQCRC2P22695 453 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 VAC14Q08AM6 782 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 C1orf61Q13536 156 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 KIR2DS5Q14953 304 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 OR2L5Q8NG80 312 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 OR8K5Q8NH50 307 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 FAM174AQ8TBP5 190 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 UCN3Q969E3 161 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 MAL2Q969L2 176 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SHDQ96IW2 340 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 KCNC2Q96PR1 638 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 RAD21L1Q9H4I0 556 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CXorf36Q9H7Y0 433 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 PRDM7Q9NQW5 492 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 OR2A25A4D2G3 310 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 A6NHS1 94 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 OR5K4A6NMS3 321 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 KRT75O95678 551 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 DRD2P14416 443 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 FRKP42685 505 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ARFIP1P53367 373 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms