RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 MS4A12Q9NXJ0 267 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 H3BM21 787 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PRAMEF10O60809 474 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PIPP12273 146 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PDHA2P29803 388 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 MMP12P39900 470 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 PARP16Q8N5Y8 322 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 CHAC2Q8WUX2 184 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 VWCEQ96DN2 955 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 GULP1Q9UBP9 304 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 SH2B3Q9UQQ2 575 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 HTR3EA5X5Y0 456 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PCDH17O14917 1159 aa21.56■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 TMEM220Q6QAJ8 160 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.56■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC35B4Q969S0 331 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CENPOQ9BU64 300 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa21.56■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 GADD45GO95257 159 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CTSLP07711 333 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 TMEM215Q68D42 235 aa21.56■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 ICKQ9UPZ9 632 aa21.56■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 MED26O95402 600 aa21.55■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 TYRP14679 529 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CHMP24386 653 aa21.54■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.54■■□□□ 1.04
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HOXD1-201ENST00000331462 IL36AQ9UHA7 158 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PRB8 838 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 LILRB5O75023 590 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 KCNK2O95069 426 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PPM1AP35813 382 aa21.54■■□□□ 1.04
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